一月一日	修正会
一月八日	仁王会・寒中説法
二月節分	尊星王星祭
三月	彼岸中日法要
四月	三井古流青山茶会
五月十六日～十八日	三井寺千団子祭（鬼子母善神開扉）
七月第二土曜日	三井寺札焼
七月二十二日	本山採灯大護摩供
八月六日	原爆犠牲者慰霊法要
八月第二土曜日	三井寺納涼祭り
八月十五日	三井寺鐘供養　盆法要
八月二十四日頃	地蔵流し と 四国霊場巡拝
九月	彼岸中日法要
十月二十九日	智証大師御祥忌法要 三井古流紅楓茶会
十二月三十一日	三井晩鐘除夜の鐘

城寺の歴史をひもとくと、天智・弘文・天武天皇の勅願により、弘文天皇の皇子・大友与多王が田園城邑を投じて建立され、天武天皇より「園城（おんじょう）」の勅額を賜わり、「長等山園城寺」と称したのにはじまります。俗に「三井寺」と呼ばれるのは、天智・天武・持統天皇の産湯に用いられた霊泉があり、「御井（みい）の寺」の厳儀・三部潅頂の法水に用いられたことに由来します。
長い歴史の上で、当寺は再三の兵火にあい焼失しましたが、豊臣氏や徳川氏の尽力で再興され、現在も国宝・重要文化財・名園など貴重な寺宝を数多く伝えています。